До 20 млн, до 60 млн, до 200 млн и от 1 млрд рублей в год

Взгляд налогового консультанта

У клиники с выручкой 15 млн рублей и у сети с миллиардным оборотом разные масштабы, но налоговые проблемы обычно начинаются одинаково: бизнес растет быстрее, чем его юридическая и учетная модель.

Как оно происходит на практике: сначала появляется небольшая клиника/кабинет, собственник сам управляет и договаривается с врачами. Затем появляется второе направление, еще одно юридическое лицо, продажа товаров, собственная лаборатория, управляющая компания. И в какой-то момент модель, которая была терпимой для маленькой клиники, становится источником существенного риска.

Разделение ниже по выручке не является нормой закона. Это удобный способ показать, какие вопросы обычно становятся критичными на разных этапах роста. И речь не о гипотетических схемах. Все ошибки ниже связаны с реальными правилами НДС, УСН, налога на прибыль, лицензирования, оформления персонала и структурирования бизнеса.

На этом этапе бизнес часто еще воспринимает себя как маленький. Именно поэтому основные риски возникают не из-за сложности налогов, а из-за отсутствия системы. Пока оборот небольшой, собственнику кажется, что многие вопросы можно решить позже. Но лучшее время для настройки клиники как раз сейчас.

Ошибка № 1 Считать, что маленькая выручка позволяет не разбирать каждую услугу
отдельно

При доходе до 20 млн рублей плательщик УСН в 2026 году, как правило, пользуется автоматическим освобождением от обязанностей по исчислению и уплате НДС. Из этого легко сделать неправильный вывод: «НДС нам не нужен, поэтому разбираться с видами услуг пока
рано».

Проблема проявляется сразу после роста. У клиники к этому моменту уже есть прайс, сайт, касса и медицинская информационная система. В одном списке могут стоять консультации, диагностика, косметологические процедуры, товары, косметика, справки, программы наблюдения и другие позиции. А налоговый режим у этих операций может быть разным. Для освобождения медицинских услуг по статье 149 НК РФ важны не слова «медицинская клиника» на вывеске. Нужно, чтобы конкретная услуга относилась к освобождаемым медицинским услугам и оказывалась при наличии соответствующей лицензии.

Что проверить уже сейчас:
• Совпадает ли фактический прайс с перечнем работ и услуг по лицензии.
• Есть ли в выручке продажа товаров или иные немедицинские операции.
• Можно ли по данным кассы и МИС отделить один вид выручки от другого.
• Соответствуют ли договор, сайт и формулировки услуг тому, что реально оказывается пациенту.

Практический смысл

Карту выручки лучше собрать до превышения 20 млн рублей. Тогда при росте клинике не придется в пожарном режиме перепрошивать кассу, договоры и учет.

Ошибка № 2 Заменять штатного врача самозанятым только ради экономии на
налогах и взносах

Договор с самозанятым врачом сам по себе не запрещен. Ошибка начинается, когда гражданско- правовая форма не соответствует фактическим отношениям. Если клиника сама определяет график, дает врачу пациентов, устанавливает цены, предоставляет
кабинет и оборудование, контролирует процесс и фактически встраивает специалиста в свою организационную структуру, одного статуса самозанятого недостаточно, чтобы убрать риск переквалификации отношений.

Для медицинского бизнеса есть второй уровень проверки. Помимо налоговых и трудовых рисков нужно смотреть лицензионные требования по конкретным работам и услугам, а также соответствие квалификации и аккредитации медицинского персонала.

Что делать:

• Разделить реальных независимых подрядчиков и сотрудников, которые фактически работают как штат.
• По каждому врачу проверить не только договор, но и реальную модель работы.
• Сверить кадровую модель с лицензионными требованиями по тем работам, которые выполняет врач.

Ошибка № 3 Использовать счет клиники как личный кошелек собственника

У небольшой клиники собственник часто одновременно директор, управляющий и главный человек в финансах. Отсюда появляются личные покупки с корпоративной карты, переводы без понятного основания, незакрытый подотчет, займы собственнику и расходы, которые сложно связать с деятельностью клиники.

На маленьком обороте это кажется бытовой мелочью. Но именно такие привычки затем переходят в компанию с выручкой 100 или 200 млн рублей.

Для налогового консультанта вопрос звучит просто: на каком основании собственник получает деньги компании и как это отражено в учете?

Что делать:

• Определить законные способы вывода денег собственнику.
• Закрыть старые подотчетные суммы и неподтвержденные расходы.
• Проверить займы участникам и связанные с ними проценты, сроки и возврат.
• Не оплачивать личные расходы компании без понятной юридической и налоговой квалификации.

Фактически здесь особенно важна зона от 20 до 60 млн рублей. Это тот диапазон, где старое правило продолжает жить в голове у бизнеса. В 2025 году многие ориентировались на 60 млн рублей для целей освобождения от НДС на УСН. В 2026 году ключевой порог уже 20 млн рублей.

Ошибка № 1. Продолжать ориентироваться на старый порог 60 млн рублей. Это сейчас одна из самых дорогих ошибок планирования. Если доход за предыдущий год превысил 20 млн рублей, плательщик УСН в 2026 году начинает исполнять обязанности по НДС с начала года. Если порог превышен уже в течение года, обязанности возникают по установленным НК РФ правилам после такого превышения.

При этом снижение порога ниже 20 млн рублей сейчас заморожено. Поэтому ошибка не в том, что бизнес должен готовиться к 15 млн или 10 млн. Ошибка в другом: некоторые клиники по-прежнему считают, что до 60 млн рублей вообще могут не заниматься НДС.
Для медицинской организации это особенно важно, потому что статус плательщика НДС и обязанность начислять НДС на конкретную медицинскую услугу не одно и то же.

Ключевой вывод
20 млн рублей сейчас нужно использовать как контрольную точку для УСН и НДС. Но после ее прохождения нельзя автоматически прибавлять НДС ко всему прайсу.

Ошибка № 2. Считать, что медицинская лицензия освобождает от НДС всю выручку клиники

Клиника может быть медицинской организацией и одновременно получать выручку от операций, которые не подпадают под медицинское освобождение.

Самые очевидные примеры: продажа косметики и других товаров, отдельные немедицинские услуги, аренда, обучение, агентское вознаграждение, иные сервисы вокруг основной медицинской деятельности. Наличие лицензии не превращает любую выручку в освобождаемую от НДС.

Поэтому после превышения 20 млн рублей нужно не задавать вопрос «платим ли мы НДС», а строить карту операций. Напротив каждой позиции должно быть понятно, почему она облагается или не облагается НДС.

Что проверить:

• Какая часть выручки относится к медицинским услугам, освобождаемым по статье 149 НК РФ.
• Есть ли облагаемые товары и услуги.
• Настроено ли отражение необлагаемых операций в декларации по НДС.
• Можно ли корректно распределить входной НДС, если клиника применяет общеустановленные ставки и ведет смешанные операции.

Ошибка № 3. Открыть второе ООО или ИП только потому, что первое подходит к налоговому порогу

Для медицинского бизнеса эта тема особенно чувствительна. ФНС отдельно обсуждает риски дробления со стоматологическим и медицинским сообществом.

Само наличие двух клиник, нескольких ООО или ИП не является нарушением. Риск появляется, когда юридически разные лица фактически ведут единый бизнес, а основная причина разделения заключается в сохранении специального режима.

Налоговая смотрит не только на учредителей. Анализируется общая операционная модель: один сайт, один бренд, одна регистратура, общий персонал, единые кабинеты, оборудование, телефоны, база пациентов, централизованное управление и распределение выручки.

Что делать до открытия следующего юридического лица:

• Зафиксировать реальную деловую цель новой компании.
• Определить, какие ресурсы, сотрудники и функции у нее будут собственными.
• Проверить договоры и расчеты между компаниями.
• Посчитать альтернативу без дробления. Иногда она оказывается дешевле с учетом налоговых и юридических рисков.

В диапазоне условно от 60 до 200 млн рублей клиника уже редко является просто кабинетом с бухгалтером на аутсорсе. Появляются отдел продаж, маркетинг, несколько направлений, дорогое оборудование, руководители подразделений, иногда несколько юридических лиц.
Главная проблема этого этапа: бизнес уже средний, а налоговые решения продолжают приниматься как в маленькой клинике.

Ошибка № 1. Выбирать ставку НДС 5% автоматически, не считая альтернативу

Для плательщиков УСН с соответствующим уровнем дохода в 2026 году доступна специальная ставка НДС 5%. Но у нее есть принципиальная особенность: входной НДС к вычету не принимается.

У клиники с серьезными закупками оборудования, ремонтом, IT, расходными материалами и смешанной выручкой выбор между специальной ставкой и общеустановленной ставкой 22% с вычетами нужно считать на цифрах.

При этом медицинские услуги, которые освобождены по статье 149 НК РФ, не становятся автоматически облагаемыми по ставке 5%. Сначала определяется налоговый режим конкретной операции, затем считается общая экономика.

Что моделировать:

• Долю облагаемой и освобождаемой выручки.
• Объем входного НДС по закупкам и капитальным затратам.
• План инвестиций на 12–24 месяца.
• Влияние выбранной модели НДС на цену для пациента и маржинальность.

Ошибка № 2. Продолжать удерживать бизнес на УСН любой ценой, не считая ОСНО как рабочую модель

В 2026 году лимит доходов для применения УСН значительно выше 200 млн рублей. Поэтому сама выручка 200 млн рублей не заставляет клинику переходить на ОСНО.

Но стратегическая ошибка возникает, когда вокруг сохранения УСН начинают строить всю корпоративную структуру. Появляются дополнительные компании, искусственное распределение выручки и сложные взаиморасчеты, хотя собственник ни разу не посчитал альтернативу.

Для медицинских организаций общая система может выглядеть иначе, чем для обычного бизнеса. При выполнении условий статьи 284.1 НК РФ медицинская организация может применять ставку 0% по налогу на прибыль. Освобождение отдельных медицинских услуг от НДС также может сохраняться.

Это не означает, что ОСНО всегда выгоднее. Это означает, что после определенного масштаба налоговый режим нужно моделировать, а не защищать по привычке.

В расчет нужно включить:

• Налог на прибыль с учетом возможности ставки 0% и условий ее применения.
• НДС по медицинским и немедицинским операциям.
• Стоимость сохранения нескольких юридических лиц.
• Риски дробления и стоимость администрирования группы.

Ошибка № 3. Не связывать медицинскую информационную систему, кассу, банк и бухгалтерский учет

На выручке 150–200 млн рублей уже опасно строить налоговый учет только по банковской выписке и кассе.

У клиники есть предварительные оплаты, депозиты, сертификаты, возвраты, программы лечения, ДМС, лабораторные услуги, товары и разные виды медицинских услуг. Если все эти потоки классифицируются вручную в конце месяца, риск ошибок становится системным.
Для налогового аудита мы обычно сопоставляем путь денег: запись пациента, оказанная услуга, медицинский документ, кассовый чек, эквайринг, банковская выписка и бухгалтерская проводка.

Что должно быть настроено:

• Единый справочник услуг между МИС, кассой и бухгалтерией.
• Отдельная аналитика медицинской, немедицинской и товарной выручки.
• Контроль авансов, возвратов и сертификатов.
• Регулярная сверка выручки по МИС, ККТ, эквайрингу и бухгалтерскому учету.

На миллиардном обороте налоговая ошибка редко выглядит как забытая декларация. Обычно это ошибка архитектуры.

У группы есть медицинские общества, лаборатории, недвижимость, управляющая компания, IT, закупочные функции, бренд, маркетинг и централизованные сотрудники. Чем больше внутренних связей, тем важнее, чтобы каждая из них имела экономическое содержание и нормальные документы.

Ошибка № 1. Считать ставку 0% по налогу на прибыль «вечной льготой»

Медицинская организация вправе применять ставку 0% по налогу на прибыль только при соблюдении условий статьи 284.1 НК РФ.

Среди ключевых условий: наличие лицензии, не менее 90% соответствующих доходов, не менее 50% медицинского персонала с необходимыми документами в общей численности работников, не менее 15 работников в штате непрерывно в течение налогового периода и другие требования статьи.

В крупной группе проблема возникает, когда медицинское юридическое лицо начинает получать слишком много немедицинской выручки. Например, в него постепенно переносят аренду, сервисные функции, отдельные товары или иные доходы и при этом никто регулярно не контролирует 90-процентный критерий.

Что делать:

• Контролировать условия ставки 0% не раз в год, а ежемесячно или ежеквартально.
• Отдельно отслеживать долю медицинских доходов.
• Следить за численностью и долей медицинского персонала.
• До запуска нового источника выручки проверять, не влияет ли он на право на ставку 0%.

Ошибка № 2. Платить управляющей компании, владельцу бренда или сервисной компании без доказуемого содержания услуги

Крупная медицинская группа неизбежно централизует функции. Это нормально. Один центр может вести маркетинг, IT, HR, закупки, финансы и управление для нескольких клиник.
Налоговый риск появляется, когда счет внутри группы есть, а содержание услуги доказать сложно. Например, ежемесячная «управленческая услуга» выставляется одной суммой, но нет понятного состава работ, методики распределения стоимости, отчетов и связи расходов с деятельностью получателя.

То же относится к аренде, лицензированию бренда, IT и другим внутригрупповым платежам. Чем выше сумма, тем важнее не название договора, а фактическое исполнение и экономическое обоснование.

Что должно быть в порядке:

• Понятный состав каждой внутригрупповой услуги.
• Доказательства фактического исполнения.
• Экономически объяснимый принцип распределения затрат между компаниями.
• Соответствие договоров реальной модели бизнеса.
• Проверка налоговых последствий по налогу на прибыль и НДС.

Ошибка № 3. Централизовать бизнес фактически, но не оформить юридические и налоговые связи внутри группы

У большой сети может быть единый call-центр, сайт, мобильное приложение, маркетинг, программа лояльности, закупки и единый бренд. Для пациента это одна сеть. Но услуги пациенту оказывают разные юридические лица.

Ошибка возникает, если деньги принимает одна компания, услугу оказывает другая, персонал числится в третьей, оборудование принадлежит четвертой, а договоры между ними не соответствуют фактическим потокам.

Это уже не только налоговый вопрос. Такая несогласованность затрагивает признание выручки и расходов, НДС, лицензионные требования, договор с пациентом и ответственность перед ним.

Что проверять на уровне группы:

• Кто заключает договор с пациентом и кто фактически оказывает услугу.
• Кто принимает оплату и на каком основании.
• Кому принадлежат помещения и оборудование.
• Где оформлены врачи и административный персонал.
• Какие договоры регулируют использование общих ресурсов.
• Совпадает ли юридическая модель с тем, как сеть реально работает.

Независимо от размера клиники можно начать с пяти вопросов. Они быстро показывают, где бизнес уже вырос из своей старой модели.

• Могу ли я по каждой строке прайса объяснить, кто оказывает услугу, по какой лицензии и как она облагается НДС?
• Если у меня несколько компаний или ИП, могу ли я объяснить деловую цель каждого без слов «лимит», «УСН» и «НДС»?
• Соответствует ли оформление врачей тому, как они фактически работают?
• Могу ли я за один день сверить выручку по МИС, кассе, эквайрингу и бухгалтерии?
• Если мы применяем налоговую льготу, контролируем ли мы ее условия в течение года, а не только перед сдачей декларации?

Главная мысль
Чем больше клиника, тем реже проблема заключается в одной неверной проводке. Основные потери возникают тогда, когда налоговая, юридическая и операционная модели перестают совпадать.